工具1 GraphPad Prism作图教程

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工具1 GraphPad Prism作图教程
发布日期:2024-10-14 16:48    点击次数:184

原创 王子晗Zoheth A大调不是ATCG的A2023-11-28 23:15 发表于广东

GraphPad Prism不能说是所有科研人画图必备,也得说是每一个科研人画图必备!

本系列笔记分两部分。第一部分是本篇,主要介绍GraphPad Prism7如何制作常用的文献图,解决怎么做图的问题。现在已经升级到10版本了,不过换汤不换药,主要功能变化不大。第二部分是介绍常用的统计分析方法,解决做什么图的问题。笔记来自某大型平台的教程,ppt也做得很棒。

记得周末音乐(抖音上一位教在家做音乐的老师)说过,学习Cubase(编曲软件)最好先直接上来做,遇到什么问题再去寻找解决问题的方法,而不是系统地从头到尾学一遍,这样比较浪费时间。

使用这个软件也一样,在使用过程中发现柱子间距太小,或需要用到不连续坐标轴等等问题时,带着问题再来这里寻求答案是更快捷的方法。

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一、主要功能与界面介绍1. 数据表格界面与Excel相似,可将数据录入后保存。

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2. 数据图类型通过下面图例,可一目了然地看出各图在什么情况下使用。(1)XY图:适合于连续变化的数据。(2)Column(单维度分组图):适合于一种因素的分组数据。(3)Grouped(二维度分组图):适合于双向变量的分组数据,即每一列定义一个组别,每一行也定义一个组别。(4)Contingency(列联表):临床应用较多,此文略。(5)Survival(生存曲线):表示生存曲线。(6)Parts of whole(整体比例):展现各部分数据占比。

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二、折线图绘制方法

1. 选择作图类型

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2. 输入数据(3次重复)

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3. 选择样式

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4. 修改图例、标题、作图区、坐标轴(哪里要改点哪里,单击或双击,玩一玩就会啦)、整体字体(1)作图区格式修改

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(2)坐标轴整体修改

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(3)坐标轴独立格式修改

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(4)坐标轴标题字体格式修改

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(5)整体文字格式修改

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三、单维度分组图只有一种因素的分组。由于图表格式设置等和前面相似,后面只展示不同的处理部分。(一)柱形图1. 选择作图类型(Column)

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2. 输入数据,选择样式

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3. 修改坐标轴标题、坐标轴、作图区等4. 对柱子间距、宽度、Y轴刻度方向等进行调整

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5. 设置Y坐标轴标题和标签距离坐标轴线的距离

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6. 不连续坐标轴设置

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(二)散点图1. 选择作图类型(Column)2. 输入数据,选择散点图

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3. 修改坐标轴标题,双击作图区空白位置设置散点图格式

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4. 修改X轴,将标签的倾斜度改为水平

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四、二维度分组柱形图适合于二重分组的数据,即数据分组具有双向变量,每一列定义一个组别,每一行也定义一个组别。1. 选择作图类型(Group)

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2. 输入数据,选择样式

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3. 修改坐标轴标题和字体4. 修改图形格式5. 设置柱子粗细、刻度方向等* 3-5方法同前。6. 若设置叠加图,可进行如下操作:

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四、生存曲线图随访时间、在随访时间上的生存状态及影响因子(如基因表达)是必要因素。生存曲线不仅可以用于比较生存率,还可用于其他结局事件是二分类变量的分析,如是否复发,是否转移等。1. 研究因素分组:可利用MEDIAN函数(中位数函数)、IF函数(条件函数)计算出表达列的中位数,将数据分为高表达和低表达组(低于中位数为低表达组,其余为高表达组)。2. 替换数据:在Excel中将Alive替换成0,Dead替换成1。

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3. 选择生存曲线(Survival),X为随访时间,Group A为低表达组,Group B为高表达组。Excel中将低表达、高表达数据分别筛选出来复制到Prism数据表。

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4. 选择样式,修改标题

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5. 修改作图、字体等

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6. 如需要选择全框,双击坐标轴,点击Frame and Origin→Frame style中调整。五、热图7.0版本新增功能。热图利用不同颜色反应数值大小,直观反映数值差异。

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1. 新建数据表(Group),数据独立无重复,选择第一个选项。

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2. 输入数据,选择样式(Heat Map,第四个色系最常用)

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3. 修改标签:将原始的横纵轴标签改为行、列标签,行标签位置居于顶部。

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4. 调宽格子:Graph Settings→Shape and size→Width调大。也可以拖动作图区长度。

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5. 色条属性设置:双击色条属性框→Color mapping→Range设置色条范围。最小值设置为比数据最小值小的整数,最大值设置为比数据最大值大的整数色条水平放置:Legend→Orientation,选择水平色条标签:Legend→Scale,设置色条标签间隔及起始值

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6. 拖动色条边角,设置色条大小及位置7. 设置字体 本站仅提供存储服务,所有内容均由用户发布,如发现有害或侵权内容,请点击举报。

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